国税庁「給与情報のマイナポータル連携に関するＦＡＱ」等を公表＜源泉所得税関連＞

掲載日：2026.05.07

　令和８年５月１日(金)、国税庁ホームページで「給与情報のマイナポータル連携に関するＦＡＱ」等が公表されました。

「給与所得の源泉徴収票」はe-Taxで！【事業者用ページ】（更新）
https://www.nta.go.jp/taxes/tetsuzuki/mynumberinfo/kyuyogensenjoho-jigyousyapage.htm
以下のＦＡＱが更新されました。
○【令和９年１月以降版】給与情報のマイナポータル連携に関するＦＡＱ（事業者向け）
https://www.nta.go.jp/taxes/tetsuzuki/mynumberinfo/pdf/0026004-106_01.pdf
○給与情報のマイナポータル連携に関するＦＡＱ（事業者向け）（令和８年４月30日）
https://www.nta.go.jp/taxes/tetsuzuki/mynumberinfo/pdf/kyuyogensenjoho-faq.pdf
「【令和９年１月以降版】給与情報のマイナポータル連携に関するＦＡＱ（事業者向け）」は１０ページの資料で、「令和８年4月30日更新」のＦＡＱは以下のとおりです。
１共通
問１給与情報のマイナポータル連携とは何ですか。【令和８年4月30日更新】
問３給与情報のマイナポータル連携と「日本版記入済み申告」（書かない確定申告）の関係について教えてください。【令和８年4月30日更新】
問４前年分の給与情報のマイナポータル連携は、いつから利用できるようになりますか。【令和８年4月30日更新】
問５給与支払報告書等がオンライン提出されていないと、給与情報の自動入力はされないのですか。【令和８年4月30日更新】
問６令和９年1月1日以後の給与所得の源泉徴収票及び給与支払報告書の取扱いについて、どのように変わりますか。【令和８年4月30日更新】
問７給与支払報告書のどの情報が自動入力の対象となりますか。【令和８年4月30日更新】
問８給与情報の自動入力を利用するために、何か事前に準備をする必要はありますか。【令和８年4月30日更新】
２事業者向け
(1) 提出範囲
問１給与支払報告書や給与所得の源泉徴収票の提出範囲を教えてください。【令和８年4月30日更新】
(2) 提出方法
問１どのような提出方法で提出すれば給与情報がマイナポータルに連携されるのでしょうか。【令和８年4月30日更新】
問２書面や光ディスク等の方法で提出した給与支払報告書等は自動入力の対象となりますか。【令和８年4月30日更新】
問３書面や光ディスク等で提出した給与支払報告書等が自動入力の対象とならないのはなぜですか。【令和８年4月30日更新】
問４市販の会計ソフト等を使用して給与支払報告書を地方税ポータルシステム（eLTAX）で提出した場合は、マイナポータル連携の対象となるのでしょうか。【令和８年4月30日更新】
問５地方税ポータルシステム（eLTAX）で給与支払報告書を提出した後、訂正のために市区町村に給与支払報告書を書面で提出した場合、どうなりますか。【令和８年4月30日更新】
問６地方税ポータルシステム（eLTAX）で給与支払報告書を提出した場合、従業員の e-Tax にはどのくらいのタイミングで連携されるのでしょうか。【令和８年4月30日更新】
問７これまでは給与支払報告書等を地方税ポータルシステム（eLTAX）の電子的提出一元化機能で提出していましたが、引き続きマイナポータルに連携するためにはどうしたらいいですか。【令和８年4月30日更新】
(3) 入力項目
問１給与情報をマイナポータルに連携するために、給与支払報告書等を作成する際に留意すべきことはありますか。【令和８年4月30日更新】
問２マイナンバーの提供を受けられない従業員については、給与支払報告書等にその従業員のマイナンバーを入力して提出することができませんが、このような場合でもマイナポータル連携の対象となるのでしょうか。【令和８年4月30日更新】
問３誤った内容の給与支払報告書等を提出した場合、自動入力される情報はどうなるのですか。【令和８年4月30日更新】
(4) その他
問１いつまでに提出された給与支払報告書等が自動入力の対象となりますか。【令和８年4月30日更新】
問３給与所得の源泉徴収票については、事業者から納税者へ交付義務があるかと思いますが、今回の手続きで給与支払報告書を地方税ポータルシステム（eLTAX）で提出した場合は、事業者から従業員へ交付されたものとみなされるのでしょうか。【令和８年4月30日更新】
問４従業員から、給与支払報告書の市区町村への提出方法が地方税ポータルシステム（eLTAX）か否か等について問合せがあった場合、回答しないといけないのでしょうか。【令和８年4月30日更新】
給与所得の確定申告がさらに簡単に！【利用者用ページ】（更新）
https://www.nta.go.jp/taxes/tetsuzuki/mynumberinfo/kyuyogensenjoho-top/userpage.htm
以下のＦＡＱが更新されました。
○給与情報のマイナポータル連携に関するＦＡＱ（利用者向け）（令和８年４月30日）
https://www.nta.go.jp/taxes/tetsuzuki/mynumberinfo/kyuyogensenjoho-top/pdf/0023010-050.pdf

以上

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